黨政辦公室

（績效管理考核辦公室）

黨委組織部

（人才工作部、機關黨委）

黨委宣傳統戰部

綜合監察室

審查調查室

審計處

教務處（繼續教育處）

科技處

學生工作處

（學生工作部、武裝部）

招生就業處

（創新學院）

國際交流合作處

醫院管理處

離退休工作處

人事處（教師工作部、教師教學發展中心）

計劃財務處

招標與采購

辦公室

資產管理處

后勤基建處

保衛處

工會

團委

研究生學院（研究生工作處、學位辦公室、學科發展規劃處）

國際教育學院

中醫學院（中醫基礎理論研究所）

中西醫結合學院

藥學院（中藥研究所）

針灸推拿學院（養生康復學院、針灸研究所）

護理學院

經濟管理學院

信息工程學院

外國語學院

醫學檢驗學院

實驗動物醫學與科學學院（實驗動物中心）

繼續教育學院

馬克思主義學院

體育部

中醫文獻研究院（博物館）

遼寧省中醫藥科學院

中醫藥創新工程技術中心

教學實驗中心（醫護實訓中心）

高等中醫藥教育研究及評價中心

發展研究中心（法律事務辦公室）

圖書館

信息中心

編輯部

門診部

大連校區

管理委員會

本溪校區

管理委員會

遼寧中大資產經營管理有限責任公司

聯合辦學（杏林學院）

遼寧中醫藥大學附屬醫院（第一臨床學院、遼寧省中醫院、臨床研究所）

遼寧中醫藥大學附屬第二醫院（第二臨床學院、遼寧省中醫藥研究院）

遼寧中醫藥大學附屬第三醫院（第三臨床學院、遼寧省肛腸醫院）

遼寧中醫藥大學附屬第四醫院（第四臨床學院、遼寧省中西醫結合醫院）